提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

河南80岁以上人群疫苗接种率超93%******

　　图为河南省疫情防控指挥部办公室主任、河南省卫生健康委主任阚全程作主发布词。韩章云　摄

　　中新网郑州1月9日电 (记者韩章云)1月9日，河南省政府新闻办举行的“河南省统筹做好新冠病毒感染疫情防控工作新闻发布会”通报称，该省80岁以上人群新冠疫苗全程接种154.98万人、接种率93.25%。

　　河南省疫情防控指挥部办公室主任、河南省卫健委主任阚全程介绍，河南已全面开展65岁以上老年人健康状况调查，并根据老年人合并基础性疾病状况和疫苗接种等因素，分为高风险人群、中风险人群、低风险人群三个类别，分别标记为红色、黄色和绿色。

　　图为1月9日，河南省统筹做好新冠病毒感染疫情防控工作新闻发布会。韩章云 摄

　　通报称，截至1月7日，河南全省累计排查1283.42万人，其中高风险人群100.79万人，占比7.85%；中风险人群245.07万人，占比19.10%；低风险人群937.56万人，占比73.05%。

　　在疫苗接种方面，阚全程介绍，河南通过采取流动接种车进社区、进养老机构、下乡进村等措施，加快推进老年人疫苗接种。

　　通报称，截至1月7日，河南全省60～79岁人群全程接种1372.02万人、接种率98.49%，加强接种1080.63万人、接种率93.58%；80岁以上人群全程接种154.98万人、接种率93.25%，加强接种90.82万人、接种率80.27%。

　　为加强老年人健康管理，河南依托全省3.2万个家庭医生团队和11万名村医，利用电话、微信、视频、上门随访等方式，对高风险人群每周3次随访、中风险人群每周2次随访。对重点人群跟踪健康监测、用药指导和咨询服务，实行早期干预，加强早期识别。一旦发现新冠感染相关症状，立即指导就诊转诊，防止重症发生。

　　同时，河南还积极开展分级医疗救治。各乡镇卫生院和社区卫生服务中心普遍能够开展氧疗服务。郑州、洛阳、南阳、周口、漯河、鹤壁等地将部分核酸小屋改造为发热诊疗站，方便居民就近就便就医。同时，依托医共体做好分级诊疗衔接，建立重症患者转诊转运机制。对有重症倾向的高龄患者，直接转诊到二级以上综合医院。