提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
二十大代表风采丨“玫瑰姐姐”的玫瑰人生：让川西高原绽放“致富花”******
中新网成都10月7日电 题：“玫瑰姐姐”的玫瑰人生：让川西高原绽放“致富花”
作者 单鹏 安源
一片片香气浓郁、外形饱满的玫瑰鲜花片进入流水线，经过投料、提取、回流、接取纯露等工艺流程，淡黄色的玫瑰精油从大马士革玫瑰中提炼出来，9月中下旬，四川省阿坝州小金县的大马士革玫瑰进入采摘尾声。“每当玫瑰花开时，村民们满脸都是丰收的喜悦和灿烂的笑容，看到他们幸福，我就很快乐。”“玫瑰姐姐”陈望慧表示。
陈望慧参加中国共产党四川省第十二次代表大会。安源 摄陈望慧是中国共产党第二十次全国代表大会代表、小金县达维镇冒水村党支部书记。曾有人说，“小金玫瑰”从无到有，经历了很多坎坷，玫瑰姐姐用“疯子”的想法、“傻子”的做法，成就了“小金玫瑰”产业，用一朵玫瑰花致富了千万家。
作为四川涉藏地区特色产业扶贫的样本，近十年来，“小金玫瑰”蹚出一条“致富路”：“世界高原玫瑰之乡”小金全县种植玫瑰1.5万亩，覆盖了13个乡镇、46个村，辐射带动3200多户2万余人增收。
陈望慧查看玫瑰生长情况。受访者供图2011年，在外经营餐饮生意的陈望慧被选为冒水村村主任。冒水村坐落在当年中央红军长征中翻越的第一座大雪山夹金山脚下，这里土地贫瘠、野猪肆虐，是典型的贫困村。
谈起小金县最初为何选择发展玫瑰产业，陈望慧笑言小金的玫瑰产业是“被野猪啃出来的”。2011年，陈望慧在高半山查看被野猪破坏的庄稼时，意外发现地边几株玫瑰含苞待放。因为花茎带刺，野猪无法啃食。这一发现让她萌生了种植玫瑰花的念头。在先后前往7个省考察学习玫瑰品种和种植效益后，2012年，陈望慧在冒水村成立玫瑰种植专业合作社。
在村干部和党员带头试种下，60多亩玫瑰花开得很好。后来这批玫瑰花运到甘肃兰州苦水镇加工，提炼出的玫瑰精油得到同行和专家的一致认可，他们认为小金县种植环境绿色生态，而且玫瑰花期长、含油量高、香气纯正。这让陈望慧更加坚定发展玫瑰产业的想法。
“小金玫瑰”的发展并非一路坦途，其今天蒸蒸日上的场景背后，是老百姓从“不愿种”向“自愿种”的转变。玫瑰花虽然每年都种，但有的老百姓将信将疑，打心眼里不认为玫瑰花能代替庄稼，花田管理并不用心；再加上玫瑰品种不够优质，早先“小金玫瑰”成活率很低。陈望慧只好提高价格收购鲜花，让老百姓得到实惠，同时更新品种，改种产量和品质更优的大马士革玫瑰。
陈望慧(左三)在工作中。受访者供图渐有起色后，陈望慧加大投入，在村里建起玫瑰加工厂，引进生产线进行玫瑰精油、纯露、花茶、酱、鲜花饼的加工生产，采用“支部+合作社+公司+党员+农户+基地”发展模式。该模式不需要流转农户土地，老百姓在自己土地上多劳多得。随着“小金玫瑰”的名声在外打响，玫瑰不愁销路，老百姓脸上也露出灿烂笑容，“死心塌地”地跟着陈望慧种植玫瑰。
“以前一个村100多户人家，只有三四家是‘万元户’。种植玫瑰后，几乎家家户户的收入发生了翻天覆地的变化。”陈望慧说，除了显著的收入增长，玫瑰还促进民众思想观念转变，“现在大家对生活充满激情与自信，也越来越团结，期盼着共同富裕。”
疫情发生后，“小金玫瑰”出口保加利亚、新西兰、韩国等国家的海外订单被大量取消。面对市场压力，此前只负责玫瑰种植和加工的陈望慧主动投身销售前线，背上玫瑰精油化妆品来到广州开辟新市场，建立新销售渠道。“产业发展不遇到困难几乎是不可能的，但办法总比困难多。疫情平稳后，市场会逐渐回暖，我对此很有信心。”陈望慧表示。
随着乡村振兴战略的深入推进，陈望慧心中还有一幅更大的蓝图：将玫瑰产业与乡村振兴衔接起来，在一产、二产基础上发展融合高原玫瑰与红色文化的文旅产业。“种植玫瑰后，每个村有每个村的风景。”陈望慧称，冒水村正在更新基础设施，不少村民也抓紧装修房屋和庭院，为吸引游客“蓄力”，“未来乡村会发展得越来越好。”(完)
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